O espectropolarímetro emite uma luz plano polarizada sobre a amostra, e o seu fotomultiplicador detecta os componentes anti-horário (L) e horário (R) da luz plano polarizada, que são emitidos de modo diferencial após a passagem por certas moléculas, como por peptídeos e proteínas. O método mais usado pelos equipamentos é a modulação, que faz trocas constantes de radiação entre os componentes R e L da luz.